Propionigenium modestum

1.

Propionigenium modestum
ЗУЙКОВА КИРА ВЛАДИМИРОВНА,
6А КЛАСС,
МОУ «ГИМНАЗИЯ №12»
ДЕТСКИЙ ТЕХНОПАРК «КВАНТОРИУМ»,
ГОРОД САРАНСК
[email protected]

Propionigenium modestum
Propionigenium modestum грамотрицательный, строго анаэробный
организм. Имеет форму стержня и размер
около 0,5-0,6 x 0,5-2,0 мкм. Это важно для
выяснения механизма АТФ- синтазы.[1]

3.

Этимология
Слово propionigenium происходит от
латинского слова acidum propionicum,
означающего пропионовую кислоту, а genre
по-латыни означает "производить" или
"производить". [1] Modestus происходит от
латинского слова, означающего скромный,
относящийся к чрезвычайно скромному типу
метаболизма. [1]

4.

Таксономическая информация
Текущая классификация Propionigenium modestum - бактерии,
Fusobacteria, Fusobacteria, Fusobacteriales, Fusobacteriaceae,
Propionigenium, Modestum. Propionigenium
modestum и Propionigenium maris, в настоящее время, являются
единственными двумя видами, принадлежащими к
роду Propionigenium. [2] Они оба обитают в морской
среде. [3] Было обнаружено, что P. modestum более тесно
связан с Ilyobacter insuetus, чем с P. maris. P. modestum и I.
insuetus разделяют 97±4 - 98±5% 16S рРНК (рибосомной
рибонуклеиновой кислоты), в то время как P. modestum и P.
maris только доля 96±5 - 96±8%. [4] Только у двух видов семейства
Fusobacteriaceae были полностью секвенированы их геномы;
одним из них является llyobacter polytropus. [5]

5.

Открытие
P. modestum был выделен Бернхардом Шинком и
Норбертом Пфеннингом в 1982 году. [1] Впервые он
был выделен из черной анаэробной грязи из Канале
Гранде в Венеции, Италия, а позже был выделен из
человеческой слюны. [1] Первоначальное
выделение P. modestum было получено с помощью
сукцинатной среды, которая использовалась в
качестве основного источника
энергии. Сообщалось, что на каждый моль
сукцината, ферментированного P. modesetum,
приходилось от 2,1 до 2,4 грамма сухого веса
клеток, выделенных из среды. [1]

6.

Характеристики
P. modestum - это неспоровые и неподвижные бактерии .
[1] Оптимум роста - pH 7,1-7,7 и температура 33 °
C.[1] Содержание G + C составляет 33,9%. [1] Он использует
сукцинат, фумарат, малат, аспартат, оксалоацетат и пируват
для роста и ферментирует их до пропионата (ацетата) и
двуокиси углерода (CO2). [1] Этот организм оптимально растет
в пресной и соленой воде, а также в слюне человека в
анаэробных условиях. [1] Propionigenium modestum
превращает сукцинат (а также другие источники энергии) в
пропионат для выработки энергии. [6] Конверсия имеет
небольшое изменение свободной энергии, поэтому нет цепи
переноса электронов или связанного с субстратом
фосфорилирования. [1]

7.

Важность
Атфазы F-типа (аденилпирофосфатаза) обычно используют протоны в
качестве единственного связывающего иона, но впервые обнаружена
F1f0 АТФазы Propionigenium modestum, которая использует ионы натрия
(Na +). [7] [8]
Открытие АТФазы в P. modestum важно, потому что оно
продемонстрировало, что теория хемиосмоса, предложенная Питером
Д. Митчеллом, была неверной. Митчелл предположил, что H + расходуется
на синтез АТФ путем прямого взаимодействия с O2, превращая его
в H2o при производстве АТФ из АДФ. [9] Вместо этого АТФаза F-типа P.
modestum использует только Na + для управления реакцией,
демонстрируя образование H2o изO2 во время синтеза АТФ не потребляет
Н +, используемый всеми другими известными АТФазами Fтипа. [7] Таким образом, демонстрируя, что именно градиент
H + управляет АТФ-синтазой.

8.

Активность
Атфаза P. modestum действует примерно в 6 раз
выше, чем бактериальные мембраны, при 6,6 ед / мг
белка. [10] АТФаза состоит из субъединиц a, b и
c. Было обнаружено, что субъединица с чрезвычайно
стабильна и не диссоциирует во время гельэлектрофореза SDS (додецилсульфат натрия) до 120
°C. [10]

9.

Propionigenium modestum
Propionigenium modestum
Идентификатор таксономии: 2333
Propionigenium modestum Schink и Pfennig 1983
Эквивалент: Propionicigenium modestum
Название NCBI BLAST: fusobacteria
Ранг: вид
Генетический код: AAs =
FFLLSSSSYY**CC*WLLLLLPPPPHQQRRRIIIMTTTTNKKSSSRRVVVVAAAADDEEGGGGСтарты =
---M------**--*---- М------------ ММММ--------------- М------------Base1 =
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGG
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 =
TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAA
GGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 =
TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCA
GTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

10.

Систематический диапазон и комментарии:
Таблица 11 используется для бактерий, архей, прокариотических вирусов и белков
хлоропластов. Как и в стандартном коде, инициирование наиболее эффективно в августе. Кроме
того, начало GUG и UUG задокументировано у архей и бактерий (Kozak 1983, Fotheringham et al.
1986, Golderer et al. 1995, Nolling et al. 1995, Sazuka & Ohara 1996, Genser et al. 1998, Wang et al. 2003).
В E. coli UUG, по оценкам, служит инициатором примерно для 3% белков бактерии (Blattner et al.
1997). Известно, что CUG функционирует как инициатор для одного кодируемого плазмидой белка
(RepA) в Escherichia coli (Spiers and Bergquist, 1992). В дополнение к инициации NUG, в редких
случаях бактерии могут инициировать трансляцию с кодона AUU, как, например, в случае
поли(А)полимеразы PcnB и гена InfC, который кодирует фактор инициации трансляции IF3 (Polard
et al. 1991, Liveris et al. 1993, Sazuka & Ohara 1996, Binns & Masters 2002). Внутренние назначения такие
же, как в стандартном коде, хотя UGA кодирует с низкой эффективностью для Trp в Bacillus subtilis и,
предположительно, в Escherichia coli (Hatfiled and Diamond, 1993).
Происхождение(полноя)Клеточные организмы; Bacterium; Fusobacteria; Fusobacteriia;
Fusobacteriales; Fusobacteriacea; Propionigenium

11.

Список литературы
1.
2.
3.
4.
5.
Schink, Bernhard; Pfennig, Norbert (1982). "Propionigenium Modestum Gen. Nov. Sp. Nov. a New
Strictly Anaerobic, Nonsporing Bacterium Growing on Succinate" (PDF). Archives of
Microbiology. 133 (3): 209–216. doi:10.1007/bf00415003. S2CID 12948118.
Schink, Bernhard (2006). "The Genus Propionigenium". Prokaryotes. 7: 955–959. doi:10.1007/0-38730747-8_41. ISBN 9780387254975.
Janssen, Peter H.; Liesack, Werner (1995). "Succinate decarboxylation by Propionigenium maris
sp. nov., a new anaerobic bacterium bacterium from an estuarine sediment". Arch
Microbiol. 164 (1): 29–35. doi:10.1007/s002030050232. PMID 7646317.
Brune, Andreas; Ludwig, Wolfgang; Kaim, Georg; Schink, Bernhard; Evers, Stephan
(2002). "Ilyobacter insuetus Sp. Nov., a Fermentative Bacterium Specialized in the Degradation of
Hydroaromatic Compounds". International Journal of Systematic and Evolutionary
Microbiology. 52 (2): 429–432. doi:10.1099/00207713-52-2-429. PMID 11931152
Sikorski, Johannes; Chertkov, Olga; Lapidus, Alla; ... (2010). "Complete genome sequence of
Ilyobacter polytropus type strain (CuHbu1T)". Standards in Genomic Sciences. 3 (3): 304–
314. doi:10.4056/sigs.1273360. PMC 3035301. PMID 21304735.

12.

Список литературы
6. Hilpert, Wilhelm; Schink, Bernhard; Dimroth, Peter (1984). "Life by a new decarboxylationdependent energy conservation mechanism with Na+ as coupling ion". The EMBO Journal. 3 (8):
1655–1670. doi:10.1002/j.1460-2075.1984.tb02030.x. PMC 557580. PMID 16453537.
7. Jump up to:a b Laubinger, Werner; Dimroth, Peter (1988). "Characterization of the ATP Synthase
of Propionigenium modestum as a Primary Sodium Pump". Biochemistry. 27 (19): 7531–
7537. doi:10.1021/bi00419a053. PMID 2905167. Werner Laubinger and Peter Dimroth
8. Kaim, Georg (2001). "The Na -translocating F1F0 ATP Synthase of Propionigenium Modestum:
Mechanochemical Insights into the F0 Motor That Drives ATP Synthesis". Bioenergetics. 1505 (1):
94–107. doi:10.1016/s0005-2728(00)00280-2. PMID 11248192.
9. Mitchell, Peter D. (1974). "A chemiosmotic molecular mechanism for proton-translocating
adenosine triphosphatases". FEBS Lett. Amsterdam: North Holland Publishing Company. 43 (2):
189–94. doi:10.1016/0014-5793(74)80997-x. PMID 4277328. S2CID 12695073.
10. Jump up to:a b Laubinger, Werner; Dimroth, Peter (1988). "Characterization of the ATP Synthase
of Propionigenium modestum as a Primary Sodium Pump". Biochemistry. 27 (19): 7531–
7537. doi:10.1021/bi00419a053. PMID 2905167.

English Русский Правила