Изучение генетической структуры популяции. Внешние различия

1. Изучение генетической структуры популяции

2. Внешние различия

3. Внешние различия

4. Внешние различия

5. Модели популяции

Классическая
AA BB CC DD Ee FF GG
vs
Балансовая
Aa BB Cc Dd EE Ff Gg

6. «Скрытая» изменчивость

P
F1
Х
Х

7. Изоферменты

8. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP)

Замены
Indel
…GTACGTAC…
…CATGCATG…
…GTA-GTAC…
…CAT-CATG…

9. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP)

Замены
Indel
…GTACGTAC…
…CATGCATG…
…GTAGTAC…
…CATCATG…

10. Определение последовательности ДНК

11. Секвенирование нового поколения (NGS)

Jobling et al., 2014

12.

Jobling et al., 2014

13.

Jobling et al., 2014

14.

Jobling et al., 2014

15.

16. ПЦР в реальном времени (RT-PCR)

Syvänen, Nat. Rev. Genetics, 2001

17. ДНК-чипы

Walker and Siminovitch, Nat. Clin. Pract. Rheumatology, 2007

18. Инсерции и делеции (в т.ч. МГЭ)

…GTACATCCGTAC…
…CATGTAGGCATG…
…GTA----CGTAC…
…CAT----GCATG…

19.

http://www.wormbook.org/chapters/www_introreversegenetics/introreversegenetics.html

20. Микросателлиты (STR, SSR)

Ellegren, Nat. Rev. Genetics, 2004

21.

Jobling et al., 2014

22.

23. Структурные перестройки

24. Флуоресцентная гибридизация in situ

Perry GH et al. Nat. Genet. 2007

25. Количественная ПЦР

26. Гаплотип /фаза сцепления

AaBb
AB
ab
Ab
aB

27. Прямое определение

Jobling et al., 2014

28. Клонирование

29. Разбавление (эмульсионная ПЦР)

R. Williams et al. Nat. Met. 2006

30. «Длинная» аллель-специфическая ПЦР

«Длинная» аллельспецифическая ПЦР
http://www.eyecalcs.com/DWAN/pages/v7/ch019a/014f.html

31. Анализ родословных

Jobling et al., 2014

32. Статистические подходы

Jobling et al., 2014