Полногеномный поиск ассоциаций для множества фенотипических признаков

1.

Кафедра математической теории интеллектуальных систем
Полногеномный поиск ассоциаций для
множества фенотипических признаков
Выполнила студентка
607 группы
Петрова Александра Алексеевна
Научный руководитель
Старший научный сотрудник
Галатенко Алексей Владимирович

2.

Полногеномный поиск ассоциаций
Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS, Genome-Wide Association Studies) – направление биологических
исследований, связанных с изучением ассоциаций между геномными вариантами и фенотипическими
признаками.
Подходы в исследованиях GWAS
Случай - контроль
Схема, при которой
сравниваются две большие
группы особей
Анализ количественных
фенотипических признаков
Нет разделения особей на
группу случаев и группу
контроля
SNP - отличия последовательности ДНК размером в один нуклеотид (A, T, G или C) в геноме представителей одного
вида или между гомологичными участками гомологичных хромосом.

3.

Алгоритм mtSet программного
комплекса Limix
Используется следующая статистическая модель: