Респираторные вирусы
Классификация
Классификация
КЛАССИФИКАЦИЯ
Эпидемиология ОРВИ
ОРВИ
Патогенез ОРВИ
Вирус гриппа
Внедрение в клетку, репликация и выход вируса гриппа из клетки
Патогенез
патогенез
Клинические признаки
История эпидемий вируса гриппа
Вирус гриппа
Вирус гриппа
специфическая профилактика
Парамиксовирусы
Парамиксовирусы
Схема репродукции  парамиксовирусов
Парамиксовирусы
Вирус кори
Вирус кори
Вирус кори
патогенез кори
Клиническая картина
Эпидемический паротит
патогенез паротита
Специфическая профилактика
Коронавирусы
Коронавирусы
COVID-19 (SARS-CoV-2)
Геном COVID-19 (gisaid.org)
SARS-CoV-2
SARS-CoV-2 Модель поперечного сечения большинства представителей группы Beta-CoV B. Однако у вирусных частиц SARS-CoV-2
SARS-CoV-2
Передача инфекции
Клиническая картина
Возможные осложнения COVID-19:
Лабораторная диагностика
Иммунитет
Вакцина
Аденовирусная инфекция
Патогенез
Клиническая картина
Лабораторная диагностика
Лабораторная диагностика
ПЦР
благодарю за внимание!
29.15M
Категория: МедицинаМедицина

Респираторные вирусы

1. Респираторные вирусы

к.м.н. Давидович Наталия Валерьевна
доцент кафедры клинической биохимии,
микробиологии и лабораторной
диагностики

2. Классификация

КЛАССИФИКАЦИЯ
I. Orthomyxoviridae
Inluenzavirus (Alphainfluenzavirus, Betainfluenzavirus, Gammainfluenzavirus,
Deltainfluenzavirus)
В обозначение штаммов вирусов гриппа включают:
1. тип;
2. место выделения (географическое происхождение штамма);
3. индекс, присвоенный в лаборатории (порядковый номер штамма);
4. год выделения;
5. индекс поверхностных белков, ставится последним и заключается в скобки, имеет
смысл только для вируса типа «A»;
Примеры: «А (Бразилия) 11/78 (H1N1)» (вирус гриппа «A» человека с
гемагглютинином H1, нейраминидазой N1, выделенный в Бразилии в 1978 г.),
«A/Moscow/10/99 (H3N2)», «A/New Caledonia/120/99 (H1N1)», «B/Hong Kong/330/2001»,
«A/Fujian/411/2002 (H3N2)»

3. Классификация

КЛАССИФИКАЦИЯ
II. Paramyxoviridae / Paramyxovirinae
Род Morbillivirus (7 видов)
Measles morbillivirus [syn. Measles virus] — Вирус кори
Род Respirovirus (5 видов)
Human respirovirus 1 [Human parainfluenza virus 1] — Вирус парагриппа человека 1 тип;
Human respirovirus 3 [Human parainfluenza virus 3] — Вирус парагриппа человека 3 типа
Murine respirovirus [Sendai virus] — Вирус Сендай
Род Rubulavirus (17 видов)
Human rubulavirus 2 [Human parainfluenza virus 2] — Вирус парагриппа человека 2 типа
Human rubulavirus 4 [Human parainfluenza virus 4] — Вирус парагриппа человека 4 типа
Mumps rubulavirus [Mumps virus] — Вирус эпидемического паротита

4. КЛАССИФИКАЦИЯ

III. Coronaviridae (HCoV, SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2 - COVID-19 )
IV. Picornaviridae
Rhinovirus — 113
Parechovirus (1,2)
V. Reoviridae
Orthoreovirus -3
VI. Adenoviridae
Mastadenovirus — 42 (3,4,7,12,21)
VII.Parvoviridae (Bocavirus (HBoV -2005))
VIII. Mimiviridae (Mimivirus)

5. Эпидемиология ОРВИ

Источник инфекции
Больной человек
Пути передачи инфекции:
Воздушно-капельный
Воздушно-пылевой
Контактный (адено-, рино-, RS-вирусы)

6. ОРВИ

7. Патогенез ОРВИ

8. Вирус гриппа

Вирион (инфекционная частица) гриппа имеет
форму сферы или приближающуюся к
шарообразной, его диаметр 100−120 нм.
Вирус гриппа представляет собой оболочечный
вирус: внешний слой — липидная мембрана, в
которую вставлены «шипы»: гликопротеины и
матриксный белок M2, формирующий ионные
каналы. Под липидной мембраной расположен
матричный (матриксный) белок M1, он
формирует внутренний слой оболочки вируса,
придает устойчивость и жесткость внешней
липидной оболочке.
Гликопротеины гемагглютинин и нейраминидаза
— ключевые белки для размножения вируса типов
«A» и «B». Гемагглютинин используется для
проникновения в клетку, нейраминидаза — для
выхода из неё.

9. Внедрение в клетку, репликация и выход вируса гриппа из клетки

1. Прикрепление внешней частью HA к сиаловым
кислотам на поверхности клеток−мишеней и
проникновение в клетку посредством эндоцитоза.
2. Низкий pH внутри эндосомы приводит к изменению
во второй части HA, в результате происходит изменение
конформации HA и вирусная мембрана сливается с
мембраной эндосомы.
3. Проникновение вирусной РНК в цитоплазму клетки и
далее в клеточное ядро.
4. Репликация вирусной РНК в клеточном ядре
(полимеразы PA, PB1 и PB2), синтез вирусных белков в
цитоплазме, процессинг белков M1, HA и NA - в
эндоплазматическом ретикулуме и аппарате Гольджи.
5. На клеточной мембране из синтезированных белков,
комплексов vRNP и собственно мембраны собираются
новые вирусные частицы, которые отпочковываются от
клетки с помощью гликопротеина NA.

10. Патогенез

Инкубационный период развития гриппа составляет от 3 до 24
часов с момента заражения.
Вирус гриппа имеет сродство к эпителию трахеи и верхней части
бронхов, некоторые штаммы — к эпителию кишечника.

11. патогенез

1. Вирусные частицы проникают к клеткам эпителия дыхательных путей,
преимущественно цилиндрического эпителия трахеи и бронхов, прикрепляются к
ним и с помощью гемагглютинина «впрыскивают»
фрагменты РНК и белки через клеточную мембрану внутрь клетки.
2. РНК вируса синтезирует белки и РНК для новых вирусов, и белки собирают их в
новые вирусные частицы.
3. Вирусные частицы выходят из клетки с помощью нейраминидазы, либо, реже,
вызывают апоптоз клетки.
4. Развивается иммунный ответ организма на клетки с остатками гемагглютинина на
поверхности мембраны — высвобождается большое количество цитокинов.
5. В кровеносной системе нарастает повреждение эпителия и базальной мембраны,
увеличение проницаемости капилляров.
6. В лёгких вирусный белок PB1-F2 уничтожает тканевые макрофаги, образуя брешь в
защите лёгких от инфекций.

12. Клинические признаки

раздражение верхних дыхательных
путей: сильный кашель;
заторможенность нервных реакций,
мышечная (миалгия) и головная боль в
результате повреждений нервных
клеток при иммунном ответе на вирус
гриппа;
симптомы отравления организма:
повышение
температуры, озноб, миалгия и головная
боль;
симптомы повышенной сосудистой
проницаемости и разрыва
капилляров: стазы и геморрагия.

13. История эпидемий вируса гриппа

14. Вирус гриппа

15. Вирус гриппа

16. специфическая профилактика

17. Парамиксовирусы

ПАРАМИКСОВИРУСЫ
ПАРАГРИПП
ПАРОТИТ
КОРЬ
РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫЙ ВИРУС

18. Парамиксовирусы

ПАРАМИКСОВИРУСЫ
Вирионы имеют сферическую форму,
диаметр 150—200 нм.
Геном представлен однонитевой
нефрагментированной (-)РНК, что сильно
ограничивает сопротивляемость к мутации.
Жизненный цикл вирусов парагриппа
проходит в цитоплазме клетки, так как, в
отличие от вирусов гриппа,
парамиксовирусы не нуждаются в
затравочной мРНК для своей транскрипции.
Имеют HA и NA (кроме RS-вируса; у вируса
кори нет NA), расположены в одном
гликопротеиновом пучке.

19. Схема репродукции  парамиксовирусов

Схема репродукции
парамиксовирусов
Вирус связывается
гликопротеинами оболочки с
поверхностью клетки и сливается с
плазмалеммой (1).
С геномной минус нити РНК вируса
транскрибируются неполные плюс
нити РНК, являющиеся иРНК (2) для
отдельных белков и полная минус
нить РНК – матрица для синтеза
геномной минус РНК вируса (3).
Нуклеокапсид связывается с
матриксным белком и
гликопротеин-модифицированной
плазмалеммой. Выход вирионов –
почкованием (4).

20. Парамиксовирусы

21.

22. Вирус кори

Корь (Measles morbillivirus) — острое инфекционное вирусное заболевание с
очень высоким уровнем контагиозности (90 %), которое характеризуется
высокой температурой (до 40,5 °C), воспалением слизистых оболочек полости
рта и верхних дыхательных путей, конъюнктивитом и характерной пятнистопапулёзной сыпью кожных покровов, общей интоксикацией.
По оценкам ВОЗ, в 2017 году в мире от кори погибло около 110 тысяч человек,
92 тысячи из них — дети в возрасте до пяти лет.
Корь остается одной из заметных причин детской смертности в развивающихся
странах (1.3 % детской смертности на 2016 год).
В России заболеваемость корью в 2018 году составила 1,7 случаев
на 100 000 человек - ?

23. Вирус кори

Cферическая форма и диаметр 120—
230 нм.
Вирус состоит из нуклеокапсида —
минус-нити РНК, трёх белков и внешней
оболочки, образованной матричным
белком и двумя поверхностными
гликопротеинами: один из них —
гемагглютинин, другой — «фьюжен»
белок.

24. Вирус кори

25. патогенез кори

1. Проникновение вируса в организм человека происходит через слизистую оболочку
верхних дыхательных путей и далее с током крови (первичная виремия) вирус
попадает в ретикулоэндотелиальную систему (лимфатические узлы) и поражает все
виды белых кровяных клеток.
2. С 3-го дня инкубационного периода в лимфоузлах, миндалинах, селезёнкеможно
обнаружить типичные гигантские многоядерные клетки Warthin-Finkeldey с
включениями в цитоплазме.
3. После размножения в лимфатических узлах вирус снова попадает в кровь,
развивается повторная (вторичная) вирусемия, с которой связано начало клинических
проявлений болезни.
4. Вирус кори подавляет деятельность иммунной системы (возможно
непосредственное поражение Т-лимфоцитов), происходит снижение иммунитета и,
как следствие, развитие тяжёлых вторичных, бактериальных осложнений с
преимущественной локализацией процессов в органах дыхания.

26. Клиническая картина

Инкубационный период 8—14 дней (редко до 17 дней).
Острое начало — подъём температуры до 38-40 °C, сухой кашель,
насморк, светобоязнь, чихание, осиплость голоса, головная боль, отёк век и
покраснение конъюнктивы, гиперемия зева и коревая энантема — красные пятна
на твёрдом и мягком нёбе.
На 2-й день болезни на слизистой щёк в области моляров появляются мелкие
белёсые пятнышки, окружённые узкой красной каймой: это так называемые
пятна Бельского — Филатова — Коплика, представляющие
собой патогномоничный симптом кори.
Коревая сыпь (экзантема) появляется на 4—5-й день болезни, сначала на лице,
шее, за ушами, на следующий день на туловище и на 3-й день высыпания
покрывают разгибательные поверхности рук и ног, включая пальцы. Сыпь состоит
из мелких папул, окружённых пятном и склонных к слиянию (в этом её
характерное отличие от краснухи, сыпь при которой не сливается).
Обратное развитие элементов сыпи начинается с 4-го дня высыпаний: температура
нормализуется, сыпь темнеет, буреет, пигментируется, шелушится (в той же
последовательности, что и высыпания).

27. Эпидемический паротит

Вирионы полиморфны, округлые
вирионы имеют диаметр 120—300
нм.
Однонитевая и нефрагментированная
«минус»-РНК кодирует 8 белков, в
том числе Н-, N- и F-белки
суперкапсидной оболочки.

28. патогенез паротита

Входные ворота инфекции – верхние дыхательные пути
Размножение вируса в слизистых оболочках полости рта
Проникновение вируса по стенонову протоку в
околоушную железу
Поступление в кровь и диссеминация по организму
Поражение внутренних органов: яичек, яичников,
щитовидной и поджелудочной желез, почек и ГМ
Развитие осложнений: орхит, оофорит, менингит,
менингоэнцефалит, тиреоидит ит.д.
Последствие перенесенного двустороннего орхита –
половая стерильность (бесплодие)

29.

30. Специфическая профилактика

В соответствии с российским национальным календарём
прививок, который утверждён приказом Министерства
здравоохранения РФ № 125н от 21 марта 2014 г., вакцинация
против кори проводится комбинированной живой вакциной от
кори, краснухи и паротита одновременно в возрасте 12 месяцев,
ревакцинация — в 6 лет.

31. Коронавирусы

КОРОНАВИРУСЫ
Семейство коронавирусов (лат. Coronaviridae)
РНК - содержащие вирусы
46 видов

32. Коронавирусы

КОРОНАВИРУСЫ
HCoV-229E — Alphacoronavirus, впервые выявлен в середине 1960-х годов;
HCoV-NL63 — Alphacoronavirus, возбудитель был выявлен в Нидерландах в
2004 году;
HCoV-OC43 — Betacoronavirus A, возбудитель выявлен в 1967 году;
HCoV-HKU1 — Betacoronavirus A, возбудитель обнаружен в Гонконге в 2005
году;
SARS-CoV — Betacoronavirus B, возбудитель тяжёлого острого
респираторного синдрома, первый случай заболевания которым был
зарегистрирован в 2002 году;
MERS-CoV — Betacoronavirus C, возбудитель ближневосточного
респираторного синдрома, вспышка которого произошла в 2015 году;
SARS-CoV-2 — Betacoronavirus B, выявленный во второй половине 2019,
вызвавший пандемию пневмонии нового типа COVID-19

33. COVID-19 (SARS-CoV-2)

COVID-19 (SARS-COV-2)
COVID-19 (аббревиатура от англ. COronaVIrus Disease 2019),
ранее коронавирусная инфекция 2019-nCoV
SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2)
SARS-CoV-2 был обнаружен в образцах жидкости, взятой из лёгких в группе
пациентов с пневмонией в китайском городе Ухань в декабре 2019 года.
SARS-CoV-2 относится к подроду Sarbecovirus и является седьмым по счёту
известным коронавирусом, способным заражать человека
Вирус является результатом рекомбинации
коронавируса летучих мышей с другим,
пока ещё не известным, коронавирусом
Предполагается, что человеку вирус передался
от панголина

34. Геном COVID-19 (gisaid.org)

ГЕНОМ COVID-19 (GISAID.ORG)

35. SARS-CoV-2

SARS-COV-2
Размер вириона порядка 50-200 нанометров.
Белковое моделирование, осуществлённое на основе расшифрованного
генома вируса, показало, что рецептор-связывающий S-белок вируса
может иметь достаточно высокую аффинность к белку
человека ангиотензинпревращающий фермент 2 (АПФ2, англ. ACE2) и
использовать его как точку входа в клетку
В конце января 2020 года две группы в Китае и США независимо друг от
друга экспериментально показали, что именно АПФ2 является рецептором
для вируса SARS-CoV-2, так же как и для вируса SARS-CoV.
В марте 2020 в препринте статьи было выдвинуто предположение, что
вирус для проникновения в клетки человека использует белок SP, с
помощью которого взаимодействует с белком басигином (CD147)
заражаемой клетки человека

36. SARS-CoV-2 Модель поперечного сечения большинства представителей группы Beta-CoV B. Однако у вирусных частиц SARS-CoV-2

SARS-COV-2 МОДЕЛЬ ПОПЕРЕЧНОГО СЕЧЕНИЯ
БОЛЬШИНСТВА ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ ГРУППЫ BETA-COV B. ОДНАКО
У ВИРУСНЫХ ЧАСТИЦ SARS-COV-2 ОТСУТСТВУЕТ БЕЛОК
HEMAGGLUTININ ESTERASE (HE)

37. SARS-CoV-2

SARS-COV-2
SARS-CoV-2 является вирусом с оболочкой. Липидный бислой оболочки
таких вирусов довольно чувствителен к высыханию,
повышенной температуре и дезинфицирующим агентам, поэтому такие
вирусы легче поддаются стерилизации, чем непокрытые вирусы, хуже
выживают вне хозяйской клетки и обычно передаются от хозяина к хозяину.
Вирус держится на большинстве поверхностей около 72 часов и лучше
сохраняет жизнеспособность на пластике и нержавеющей стали, чем,
например, на меди и картоне; в воздухе возбудители заболевания держатся
до трёх часов (что подтверждает воздушно-капельный путь заражения)
К настоящему времени не существует достаточно полных и достоверных
оценок жизнестойкости и сохранения активности вируса вне организма, изза большого количества влияющих факторов, относительно незначительного
времени наблюдения и небольшого количества полученных данных.

38. Передача инфекции

ПЕРЕДАЧА ИНФЕКЦИИ
Вирус передаётся воздушно-капельным путём через вдыхание мелких
капель, распылённых в воздухе при кашле, чихании или разговоре.
Капли с вирусом могут попадать на поверхности и предметы, а затем
инфицировать прикоснувшегося к ним человека через последующие
прикосновения к глазам, носу или рту.
Вирус может оставаться жизнеспособным в течение нескольких часов,
попадая на поверхности предметов.
По данным Китайского центра по контролю и профилактике
заболеваний жизнеспособный вирус был обнаружен в фекалиях
больных COVID-19, что означает возможность фекально-оральной
передачи инфекции, например, через контаминированные руки, пищу
и воду, однако данный механизм передачи не является основным в
случае COVID-19

39. Клиническая картина

КЛИНИЧЕСКАЯ КАРТИНА
Инфекция, вызывается вирусом SARS-CoV-2, инкубационный
период составляет 1—14 дней, может протекать бессимптомно, в лёгкой
форме и в тяжёлой форме, с риском смерти, но полная клиническая
картина пока ещё не ясна. Симптомы развиваются в среднем на 5—6 день
с момента заражения. Пациенты с лёгкими симптомами обычно
выздоравливают в течение недели.
Проявляется в трёх основных клинических формах:
острая респираторная вирусная инфекция лёгкого течения с наличием
симптомов инфекции верхних дыхательных путей (в большинстве
случаев);
пневмония без угрозы для жизни;
тяжёлая пневмония с острым респираторным дистресс-синдромом.

40. Возможные осложнения COVID-19:

ВОЗМОЖНЫЕ ОСЛОЖНЕНИЯ
COVID-19:
острый респираторный дистресс-синдром, от 15 % до 33 %;
острая дыхательная недостаточность, 8 %;
острая сердечная недостаточность, от 7 % до 20 %;
вторичная инфекция, от 6 % до 10 %;
острая почечная недостаточность, от 14 % до 53 %;
септический шок, от 4 % до 8 %;
кардиомиопатии, у 33 % критических;
диссеминированное внутрисосудистое свёртывание, у 71 %
погибших;
осложнения беременности, не исключаются.

41. Лабораторная диагностика

ЛАБОРАТОРНАЯ ДИАГНОСТИКА
Диагностировать вирус возможно при помощи полимеразной
цепной реакции с обратной транскрипцией в реальном времени
(материал - мокрота, но можно использовать и слизь из верхних
дыхательных путей)
Серодиагностика - В отличие от ПЦР, тесты на антитела не
определяют наличие активного вируса в организме, но
определяют наличие иммунитета к нему, то есть наличие IgMи IgG-антител в крови

42. Иммунитет

ИММУНИТЕТ

43. Вакцина

ВАКЦИНА
В работе принимают участие
около 35 компаний и
академических учреждений
Шесть вакцин проходят
клинические исследования на
людях

44.

45.

46. Аденовирусная инфекция

АДЕНОВИРУСНАЯ
ИНФЕКЦИЯ
Вирус рода Mastadenovirus семейства
Adenoviridae
Диаметр 70—90 нм, содержат
единичную двухцепочечную
молекулу ДНК, ассоциированную с
двумя основными ядерными белками

47. Патогенез

В организм инфекция попадает через слизистые оболочки верхних
дыхательных путей, реже — кишечник либо конъюнктиву. Вирус попадает в
эпителиальные клетки и клетки лимфоидной ткани, поражает цитоплазму и
ядро, где происходит репликация вирусной ДНК.
Поражённые клетки прекращают деление и погибают.
Вирусы проникают в другие клетки слизистых оболочек и лимфатических
узлов, а также в кровь.
Это сопровождается массивным экссудативным воспалением со стороны
слизистых, т.е. накоплением в них жидкости.
Появляется конъюнктивит. Далее в патологический процесс вовлекаются
внутренние органы (лёгкие, бронхи, кишечник, почки, печень, селезёнка), а
также головной мозг, мезентериальные лимфоузлы.

48. Клиническая картина

Инкубационный период от 1 дня до 2 недель.
Заболевание начинается остро, с подъёма температуры.
Характерным является тетрада симптомов: ринит — фарингит —
конъюнктивит — лихорадка.
Также отмечаются симптомы общей интоксикации — слабость,
вялость, головная боль, отсутствие аппетита, сонливость.

49.

Эта биопсия аллотрансплантата показывает
характерные признаки аденовирусной инфекции.
Наблюдаются выраженное интерстициальное
кровоизлияние и отек (рис. 1), острое повреждение
канальцев с вирусным цитопатическим эффектом и
положительным иммуногистохимическим
цитоплазматическим и ядерным окрашиванием на
аденовирусный антиген (рис. 2), а также очаги
тубулярного некроза (рис. 3). Дифференциальный
диагноз для этой морфологии в условиях пересадки
включает другие вирусные инфекции (например,
полиомавирус, CMV, HSV), острое отторжение и
острый интерстициальный нефрит, связанный с
лекарственными средствами.

50.

У больного А. 38 лет, внезапно поднялась температура, появилась слабость, сильная головная боль, мышечные боли. Общее
состояние средней тяжести. Через сутки появился насморк. О
каком заболевании может идти речь, какие дальнейшие
действия должны быть предприняты?

51. Лабораторная диагностика

1. Реакция иммунофлюоресценции:
Прямая
Непрямая
2. Вирусологический метод

52. Лабораторная диагностика

3. Серологический метод
РТГА, РСК, РН на культуре клеток, ИФА

53.

Стадии постановки ПЦР
Подготовка пробы биологического
материала
Амплификация
Детекция в агарозном геле

54. ПЦР

Г.-Р.Бурместер, А.Пецутто/ Наглядная иммунология.М.2009

55.

Полимеразно-цепная реакция
(ПЦР)

56. благодарю за внимание!

БЛАГОДАРЮ ЗА ВНИМАНИЕ!
English     Русский Правила