Сравнительный анализ молекулярно-генетических и фенотипических свойств изогенных штаммов в. anthracis

1.

Сравнительный анализ молекулярно-генетических и
фенотипических свойств изогенных штаммов
B. anthracis
Ижбердеева М.П., Антонов А.С., Устинов Д.В., Баркова И.А., Шпак И.М.

2.

Сибирская язва - особо опасное инфекционное
заболевание
Bacillus anthracis
https://www.google.wikipedia.

3.

Плазмиды вирулентности
B. anthracis
Синтез капсулы

4.

Получение бесплазмидных вариантов
B. anthracis
t 42, 50 С
в среде
с канамицином
B. anthracis 575/122
B. anthracis 575/122 R00

5.

B. anthracis 81/1 R00
B. anthracis 575/122 R00
(штамм продуцент)
белок Sap
белок ЕА1

6.

Фенотипические свойства бесплазмидных
вариантов B. anthracis
B. anthracis 575/122 R00
B. anthracis 81/1 R00
Рост колоний на сердечно-мозговом агаре
B. anthracis 81/1 R00
B. anthracis 575/122 R00
Рост колоний на триптиказо-соевом агаре

7.

B. anthracis 575/122 R00
B. anthracis 81/1 R00
Рост колоний на кровяном агаре

8.

Электрофорез белков КФ B. anthracis.
1 - B. anthracis 81/1 R00 (рХО1-, рХО2-);
2 - B. anthracis 575/122 R00 (рХО1-, рХО2-)
Иммуноблоттинг белков КФ с сывороткой
к КФ B. anthracis СТИ.
Культуральные фильтраты:
B. anthracis 81/1 R00 (рХО1-, рХО2-).

9.

Дефект штамма B. anthracis 81/1 R00
в генах, кодирующие белки S-слоя

10.

Схема исследования
https://www.google.com/Fbiomolecula.ru
3.
Высокопроизводительное
секвенирование
1. Выделение гДНК
B. anthracis
https://www.google.com/helicon.ru
2. Создание библиотек
4. Демультиплексирование
6. Анализ данных
5. Триммирование ридов

11.

Сравнительный анализ рефесного штамма
B. anthracis Ames с полученными сборками
По гену sap
B. anthracis 81/1 R00
B. anthracis 575/122 R00

12.

По гену eag
B. anthracis 81/1 R00
B. anthracis 575/122 R00

13.

B. anthracis 81/1 R00
B. anthracis 575/122 R00
bclB
rpoB; murF;
pflB; tenI
divC; rplL
prsA; pepF
murF; pflB;
tenI; hmoA
cydC
hemH; lepB