пробное задание

1. Анализ клинических данных

АНАЛИЗ
КЛИНИЧЕСКИХ
ДАННЫХ
Тестовое задание: нежелательные явления и
описательная статистика
Караваева Софья
1

2. Задача и инструменты

ЗАДАЧА И
ИНСТРУМЕНТЫ
ЧТО НУЖНО БЫЛО СДЕЛАТЬ:
• ЗАДАНИЕ 1: ДАННЫЕ ПО
НЕЖЕЛАТЕЛЬНЫМ ЯВЛЕНИЯМ (126 НЯ У
50 УЧАСТНИКОВ)
• ЗАДАНИЕ 2: РОСТ, ВЕС И ХОЛЕСТЕРИН У
100 ПАЦИЕНТОВ В ГРУППАХ PLACEBO И
TREATMENT
2
КАК Я ЭТО СДЕЛАЛА:
• R И VS CODE, ТОЛЬКО
БАЗОВЫЕФУНКЦИИ, БЕЗ
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫХ ПАКЕТОВ
• СКРИПТЫ ВОСПРОИЗВОДИМЫ:
ЗАПУСК ЗАНОВО ДАЁТ ТЕ ЖЕ
РЕЗУЛЬТАТЫ
• ИИ-ПОМОЩНИК НА БАЗЕ CLOUDE.

3. Анализ рынка на данный момент

3
АНАЛИЗ РЫНКА НА ДАННЫЙ МОМЕНТ
Мы определили основные важные тенденции, требующие нашего
внимания.
Данные показывают постоянный рост потребительского спроса на
продукты, произведенные на основе принципов устойчивого развития.
Это открывает возможность для наших экологичных продуктов.
Наши конкуренты сейчас уделяют основное внимание стратегиям
цифрового маркетинга, предвидя изменение в поведении потребителей.
Понимание этой тонкой динамики позволяет нам адаптироваться к
новым предпочтениям рынка и воспользоваться ими.

4. Задание 1: нежелательные явления. Подход

ЗАДАНИЕ 1: НЕЖЕЛАТЕЛЬНЫЕ
ЯВЛЕНИЯ. ПОДХОД
• ПРОВЕРИЛА КАЧЕСТВО ДАННЫХ: ПРОПУСКИ, ДУБЛИКАТЫ,
ЛОГИКА ДАТ (ОШИБОК НЕНАЙДЕНО)
• РАЗДЕЛИЛА СОБЫТИЯ И УЧАСТНИКОВ: ОДНА СТРОКА = ОДНО
НЯ, УЧАСТНИК СЧИТАЕТСЯ ОДИН РАЗ
• РАССЧИТАЛА ДЕНЬ НАЧАЛА НЯ ОТ НАЧАЛА ПРЕПАРАТА И
ДЛИТЕЛЬНОСТЬ
• СОСТАВИЛА ТАБЛИЦЫ: SOC → PT, ТЯЖЕСТЬ, СЕРЬЁЗНОСТЬ,
СВЯЗЬ С ПРЕПАРАТОМ
• ПОСТРОИЛА ГРАФИКИ: НЯ ПО PT, ПО ТЯЖЕСТИ, ДЕНЬ НАЧАЛА
4

5.

5

6. результаты

РЕЗУЛЬТАТЫ
6
126
32
• нежелательных
явлений всего
• участника с
тяжёлыми НЯ
• Nausea чаще всего: 27
участников (32НЯ); далее
Dizziness и Headache
50
35
• 16-й день медиана начала
НЯ от стартапрепарата
• участников с НЯ (в
среднем 2,5НЯ на
человека)
• участников с
серьёзными НЯ

7. Задание 1: частота и тяжесть НЯ

ЗАДАНИЕ 1: ЧАСТОТА И ТЯЖЕСТЬ НЯ
Чаще всего Nausea: 27 участников
из 50, затем Dizziness (23) и
Headache (21)
Nausea даёт и больше всего тяжёлых НЯ:
около 15 из 32
7

8. Задание 1: когда возникают НЯ

ЗАДАНИЕ 1: КОГДА ВОЗНИКАЮТ НЯ
• Все 126 НЯ начались впервые 35
дней приёма
• Пик приходится на дни 10–15(25
НЯ)
• Медиана: 16-й день
• После 30-го дня началисьтолько 5
НЯ
8

9. Задание 2: холестерин. Подход

ЗАДАНИЕ 2: ХОЛЕСТЕРИН. ПОДХОД
• Проверила данные: по 50
пациентов в группе, пропусков и
дубликатов нет
• Рассчитала ИМТ = вес / рост²
• Описательная статистика по
группам: N, среднее ± SD,
медиана, квартили,min–max
• Графики: боксплоты,
гистограммы, холестерин и вес
• Сравнение групп: проверка
нормальности (Шапиро–Уилка),
t-критерий Уэлчаи Манна–Уитни
9

10.

ЗАДАНИЕ 2: РЕЗУЛЬТАТЫ
5,79 ± 0,66
Placebo: холестерин, ммоль/л
(среднее ± SD)
5,45 ± 0,57
Treatment: холестерин,
ммоль/л (среднее ± SD)
• Различие значимо: p ≈ 0,006 (t-критерий
Уэлча), p ≈ 0,024 (Манна–Уитни)
• По ИМТ различий между группами нет (p
≈ 0,22)
• Группы различаются по росту и весу,
поэтому выводы об эффекте лечения
делаюосторожно
10

11. Задание 2: сравнение групп

ЗАДАНИЕ 2: СРАВНЕНИЕ ГРУПП
• Холестерин ниже в
группеTreatment
• В Treatment выше рост и вес
• ИМТ в группах близок; есть
единичные высокие значения(до
~39), я проверила:
ониправдоподобны
11

12. Задание 2: распределение холестерина

ЗАДАНИЕ 2: РАСПРЕДЕЛЕНИЕ
ХОЛЕСТЕРИНА
У Placebo заметен «хвост» в сторону высоких
значений (до 7,3ммоль/л): поэтому я
использовала и тест Манна–Уитни
Явной связи холестерина с
весом не видно
12

13. Выводы и что дальше

ВЫВОДЫ И ЧТО ДАЛЬШЕ
• Данные проверены до анализа, ограничения
названы: нет группы лечения вданных НЯ, группы
различаются по росту и весу
• Статистическая значимость не равна
доказанному эффекту лечения
• R позволяет повторить анализ и проверить
каждый шаг, это важно дляклинических данных
• Дальше: углубить R, освоить SAS и стандарты
оформления таблиц вклинических
исследованиях
13